藻類通常是指一群在水中以浮游方式生活，能進行光合作用的自養型微生物，其種類繁多，均含葉綠素，在顯微境下觀察是帶綠色的有規則的小個體或群體。由于它們是水體中重要的有機物質制造者，故在整個水體生態系統中占有舉足輕重的作用，是生態系統中不可缺少的一個環節。但是當前水質富營養化越來越嚴重，藻類爆發的頻率增高，對生態環境和自來水的治理都產生了不好的影響。
Ⅰ、感官影響
含有藻類的原水進入凈水廠，在水處理構筑物上大量繁殖，附著在混凝土和不銹鋼上，造成感官上的差異，對現場環境有一定的影響，同時也增加了清洗構筑物的頻率和費用，即浪費水又增加工人的勞動強度。
Ⅱ、投藥量影響
對于凈水廠來說，水中含有藻類，造成水廠投藥的增大。一是在光合作用下，水中pH值升高，并且由于藻類的作用，水中溶解氧增加，礬密度降低，沉淀去除率下降，導致需要投加的混凝劑大大增多，含藻類越高的水處理需要消耗的混凝劑越多。二是藻類使原水水質發生變化，并且生長著和死亡的藻類都會使水中有機物增加，增加氯耗，高藻水的處理更需要消耗大量的消毒劑，特別對于露天處理構筑物來說，光合作用充足，適合藻類生長，春季和7、8月份是氯耗的高峰期。
Ⅲ、對構筑物池壁的影響
藻類對混凝土池壁有著很大的危害，如澄清池和虹吸濾池由于長期生長藻類物質，造成嚴重的腐蝕，使得池壁粗糙老化，為藻類的更好生長提供了有力的場所。
Ⅳ、對濾池的影響
藻類的大量繁殖對濾池的運行、濾料都有很大的影響。特別是春季和7、8、9月份，大量含藻水進入濾池，使得藻類物質在濾池中大量繁殖，不僅在濾池池壁上生長大量藻類，而且會在濾池的濾料上面形成一層毛氈，造成濾料板結，堵塞濾料層，這樣就是得濾池的周期縮短，減少產水量，同時增加沖洗水量并影響出水水質。
Ⅴ、對水質色、味、臭的影響
藻類的大量繁殖造成水質的惡化，也表現在對水質色、味、臭的影響，有的藻類會使水質變苦、變甜，甚至一些藻類造成水呈現魚腥味、惡臭味。對于我們飲水用戶來說，飲用水的好壞主要從色、味、臭判斷，但因為水質受到藻類污染，居民會經常抱怨水質有異味，發黃，發綠等，這對供水行業來說是一個很壞的影響。
